MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Lithuania75 plasmid unnamed

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017363	TAA	2	6	18	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017363	GGA	2	6	111	116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017363	AG	3	6	118	123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017363	AGG	2	6	138	143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017363	TTA	2	6	279	284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017363	T	6	6	2478	2483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017363	GTAG	2	8	2489	2496	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017363	T	6	6	2509	2514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017363	GTTG	2	8	2522	2529	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017363	A	6	6	2559	2564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017363	AAC	2	6	2569	2574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017363	A	7	7	2587	2593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017363	GTT	2	6	2610	2615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017363	AGCG	2	8	2698	2705	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017363	AAGCG	2	10	2762	2771	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017363	A	6	6	2834	2839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017363	CTC	2	6	2874	2879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_017363	ATT	2	6	3151	3156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017363	ATC	2	6	3171	3176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017363	T	6	6	3198	3203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017363	CAA	2	6	3206	3211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017363	ATT	2	6	3251	3256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017363	A	6	6	3302	3307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017363	TAA	2	6	3328	3333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017363	GTTTTT	2	12	3344	3355	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017363	TTA	2	6	3381	3386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017363	A	14	14	3395	3408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017363	A	6	6	3426	3431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017363	T	7	7	3542	3548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017363	AAT	2	6	5968	5973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017363	A	7	7	6044	6050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017363	CAC	2	6	6051	6056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017363	CTA	2	6	6067	6072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017363	ATT	2	6	6103	6108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017363	TA	3	6	6140	6145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017363	TATTTA	2	12	6155	6166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017363	CTTTTT	2	12	9879	9890	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017363	T	6	6	9906	9911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017363	T	6	6	9948	9953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017363	TG	3	6	9965	9970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017363	TTTG	2	8	9972	9979	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017363	TGT	2	6	9984	9989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017363	T	6	6	10061	10066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017363	TTGG	2	8	13008	13015	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017363	GTT	2	6	13036	13041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017363	CTT	2	6	13074	13079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017363	T	6	6	13198	13203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017363	TTG	2	6	13259	13264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017363	TTG	2	6	13271	13276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017363	AT	3	6	14627	14632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017363	TAT	2	6	14641	14646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017363	TTTTA	2	10	14647	14656	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017363	TGAT	2	8	14695	14702	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017363	TTC	2	6	15286	15291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017363	GAAT	2	8	15305	15312	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017363	TCTAA	2	10	15320	15329	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017363	ATC	2	6	15334	15339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017363	AAGCG	2	10	15606	15615	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017363	ACTAAA	2	12	15732	15743	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017363	GTT	2	6	15772	15777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017363	TTA	2	6	15779	15784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017363	AAC	2	6	15793	15798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017363	TGT	2	6	15801	15806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017363	CG	4	8	15825	15832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017363	CTT	2	6	15917	15922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017363	CTT	2	6	15939	15944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017363	CTT	2	6	15961	15966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017363	CTT	2	6	15983	15988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017363	CTT	2	6	16005	16010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.